在东方神灵庙中，有一种神秘的灵界模式，被称为东方岳灵界。在这个模式下，玩家需要通过收集灵界值来激活灵界模式，从而获得额外的战斗优势。灵界值的大小由骷髅和灵魂一样的槽反映出来，它与灵界系统密切相关。每达到一定数值，会增加一个魂灵符号单位，上限固定为三个单位。当灵界值充满一个单位时，画面中自机附近将会出现“魂灵符号x1”“魂灵符号x2”“魂灵符号MAX”及特殊音效的提示。进入灵界模式后，会消耗灵界计量表。
灵界槽有三种状态：“空”、“不空”、“满”。当灵界值小于1时，称为“空”；当1≤灵界值＜3时，称为“不空”；当灵界值等于3时，称为“满”。灵界值的增加与灵有关，尤其是白灵。魂状物体可以吸收并获得相应效果，但小神灵无法自动回收。小神灵总共有四种，共通特性是取得后灵界槽回复。
在灵界系统中，有主动灵界和被动灵界两种进入方法。主动灵界需要在灵界槽状态为“满”的时候，按下c键（trance键）；被动灵界则需要在灵界槽状态为“不空”或“满”时被弹。进入灵界系统后，游戏背景、BGM、弹幕虚化、自机无敌以及自机攻击方式会发生改变。同时，小神灵活性化，灵界中新的小神灵出现后会直接进入活性状态。
在灵界中，系统还会发生一些特殊的变化。例如，游戏背景改变，BGM改变，弹幕虚化，自机无敌，自机攻击方式改变，发出机体的最强攻击，自机具备相应的特殊能力，无法使用bomb，同时，小神灵活性化。灵界槽一个灵魂能够提供3.33秒的灵界时间，由此我们可以计算出主动灵界的持续时间约为10秒，被动灵界的持续时间在3.33秒和10秒之间，由被弹时的灵界槽多少决定。
在灵界结束后，系统会恢复到普通状态，屏幕上所有的活化神灵恢复正常状态且面积达到最大。被动灵界结束后，自机会miss并释放大量白灵。在灵界中，玩家需要通过各种手段来收集灵界值，并避免灵界值耗尽。只有充分利用灵界系统的优势，才能在游戏中取得更好的成绩。
